然而，靶向治疗并不适合所有的患者，做靶向治疗的时期和适用人群，需要精准判断。在肺癌治疗中就明确指出，早期肺癌(一、二期)禁止使用靶向治疗，因为靶向药物使用一年后可能会发生耐药，一旦出现复发，这些患者就可能面临靶向药物不能使用的窘境。遗憾的是在临床中，医生却屡屡看到“被靶向”的患者延误了病情。
不管什么类型的医疗机构或医生，如果没有先进行基因检测就给患者进行靶向治疗，都可算是滥用行为或是治疗不规范。
因为靶向治疗的应用有个硬性指标：找到癌症患者体内的“靶点”即相应的基因突变。简单说，如果化疗是将正常细胞和癌细胞一起杀死的话，靶向药则是通过抑制肿瘤生长所需的特定分子靶点，精准攻击癌细胞。
只有找到相应基因突变的患者，才能成为靶向治疗的适用对象，因此基因检测是靶向药治疗的必要前提。在肺癌中，靶向治疗主要应用于晚期非小细胞肺癌患者，这些患者体内某些基因发生了突变，其中较多见的是表皮生长因子受体(EGFR)基因突变、间变性淋巴瘤激酶(ALK)基因突变以及跨膜的受体酪氨酸激酶(ROS1)基因突变。
EGFR基因突变阳性的概率，在我国非小细胞肺癌人中能达到30%以上，也就是说只有1/3的患者适合靶向药物治疗。
事实上，原本不适合服用靶向药的患者，被建议服用靶向药，一是诊疗水平不高，治疗不规范导致;二是一些医疗机构不具备检测条件，医生及病人就都想试试看;还有就是部分患者，盲目碰运气或是看其他病友用靶向治疗效果好，就执意要求医生也给自己使用，甚至中途停止化疗而改吃靶向药物，结果导致病情恶化。
什么人能用靶向治疗，需要医生根据患者的病情而定，对于晚期非小细胞肺癌中有基因突变的患者，主张将靶向治疗作为优选方法。但在肺癌靶向治疗中还有“优势人群”，主要是指不吸烟的肺腺癌患者，这些患者EGFR基因突变阳性率为50%～60%，基因突变阳性患者使用靶向药物，有效率可以达到70%～80%。
EGFR基因突变在白种人里面，整体突变机会只有百分之十左右，而中国人全部非小细胞肺癌超过30%突变率，腺癌能达到50%的突变率。从人群来说，女性、不吸烟、腺癌这一类的患者的突变率高达60%～70%;年龄大的人突变率要比年龄小的高。另外，如果这些患者不能耐受化疗，也可以先选用靶向治疗。
在此强调，绝非所有的肿瘤患者都适合靶向药物治疗，特别是在早期肺癌的诊疗中，外科手术依然是其治疗的首选方式，以手术为主的规范化综合治疗，可使早期肺癌患者的5年以上生存率达到70%～80%。
